Available Positions – C3BI 2016 – Job Application

Ten permanent positions in Bioinformatics and Biostatistics

Bioinformatics, biostatistics and integrative biology have emerged as strategic priorities for the Institut Pasteur. A new “Center for Bioinformatics, Biostatistics and Integrative Biology” (C3BI – https://c3bi.pasteur.fr) has been created in 2015 on the Parisian campus. The objective of this center is to federate and strengthen capacities in bioinformatics and biostatistics in the different research areas developed within the institute, around biology and health.

In this framework and after 20 recruitments in 2014-2015, Institut Pasteur proposes this year again 10 permanent positions in bioinformatics and biostatistics for 2016. Successful applicants will be affiliated to the C3BI and to the Hub of bioinformatics and biostatistics and will be supervised by the director of the Center. They may be assigned for most of their time to research units and/or technological platforms. Teaching activities will also be possible, both at Paris and in the Institut Pasteur International Network.

Tasks and responsibilities:

The main objective is to provide support to research units and platforms, for the analysis of their data using bioinformatics and statistics approaches. This support will be provided in various ways:
− advising and guiding in the use of existing methods and tools,
− maintaining an active bibliographical survey and evaluate existing tools and methods,
− developing new methods and tools when necessary,
− collaborating with research units and platforms to analyze their data,
- helping, defining and implementing collaborative projects such as ANR, ERC …,
− transferring knowledge and tools towards research units and platforms, and provide training in bioinformatics and biostatistics,
− perpetuating and maintaining methods and tools developed by research units, and ensuring their integration within open platforms such as Galaxy, Mobyle…,
− actively participating to the implementation of the web portal of the Pasteur Institute bioinformatics platform, to be open to the international community,
− interacting with the Institut Pasteur International Network (IPIN, 33 institutes all around the world), mainly for setting up trainings and analyzing data.

Available positions:

Positions of 2016 will mostly focus on the following domains:

− Statistical analysis and modeling of omic data
− Statistical analysis of genetic data
− Statistical and molecular epidemiology
− New HTS data (epigenetics, single cell, long reads …)
− Eukaryotic genomics
− Human genomics
− Proteomics and mass-spectrometry data
− Annotation of proteomes (sequence/structure/function)
- Development, maintenantce and use of bioinformatics software

Expected profiles:

In order to postulate, you need to:

- hold an engineer or master degree in (bio)informatics, (bio)statistics, applied mathematics or any other related domain, followed by at least 3 years of professional experience in bioinformatics and/or biostatistics in research or support to research activity,
- or hold a PhD in bioinformatics, biostatistics, applied mathematics or any other related domain, followed by at least 2 years of professional experience in bioinformatics and/or biostatistics in research or support to research activity.

Strong experience in teaching bioinformatics/biostatistics will be a plus.

For applying

Applications (cover letter, detailed CV and referees addresses) have to be filled on line using the URL bellow:

The deadline for applications is Febuary 15th, 2016. Candidate pre-selection will take place around March 25th, 2015. Short-listed candidates will be called for an interview between the 11th and 15th April 2016 (dates to be reserved absolutly). Starting date at Institut Pasteur will be at the begining of september.

Internal HR reference : 16005ES

Dix postes (CDI) de bioinformaticiens/biostatisticiens (H/F) à l’Institut Pasteur (Paris)

La direction de l'Institut Pasteur a défini la bioinformatique et la biologie des systèmes comme priorités stratégiques. Un "Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative" (C3BI - https://c3bi.pasteur.fr/) a vu le jour en 2015 sur le campus parisien. L'objectif de ce centre est de fédérer/renforcer les activités bioinformatiques et biostatistiques dans les divers domaines de recherche de l’institut, autour de la biologie de la santé.

Dans ce contexte et après vingt recrutements en 2014-2015, l'Institut Pasteur prévoit à nouveau de recruter en CDI dix bioinformaticien(ne)s/biostatisticien(ne)s en 2016. Affiliée au C3BI et au Hub de bioinformatique et biostatistique, et supervisée par le directeur du C3BI, chaque personne recrutée sera affectée pour une part de son temps dans les unités de recherche et/ou les plates-formes technologiques. Des missions d'enseignement (académique et/ou formation permanente, possiblement à l'international) pourront aussi être confiées aux personnes recrutées.

Missions et responsabilités:

La mission principale est d’apporter un soutien aux unités de recherche et plates-formes pour l’analyse bioinformatique et/ou statistique de leurs données. Ce soutien prendra plusieurs formes:
- conseiller et guider dans l'utilisation de méthodes et outils d'analyses existants,
- maintenir une veille bibliographique active et évaluer les outils et méthodes publiés,
- développer lorsque nécessaire des méthodes et outils d'analyse nouveaux,
- analyser des données en collaboration avec les unités et plates-formes,
- participer à l'élaboration et la mise en œuvre de projets collaboratifs de type ANR ou ERC,
- assurer le transfert d'outils et de compétences vers les unités et plates-formes,
- assurer des formations en bioinformatique et biostatistiques,
- pérenniser et assurer le maintien des méthodes et des outils développés par les unités, et assurer leurs intégrations dans les solutions centrales (Galaxy, Mobyle...),
- participer activement à la mise en place du portail web de la plate-forme de bioinformatique de l’Institut Pasteur, largement ouverte à la communauté internationale,
- interagir avec le Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP, 33 instituts dans le monde entier), en particulier pour la mise en place de formations et l’analyse de données.

Profils de Poste:

Les recrutements 2016 se feront prioritairement dans les profils suivants :

- Analyse statistique et modélisation de données omics
- Analyse statistique des données génétiques
- Epidémiologie statistique et moléculaire
- Nouvelles données HTS (épigénétique, single cell, long reads …)
- Génomique des eucaryotes
- Génomique humaine
- Protéomique et données de spectrométrie de masse
- Annotation des protéomes, relations séquence/structure/fonction
- Développement, maintenance et utilisation des logiciels de bioinformatique

Profils des candidats et conditions:

Pour postuler il est necessaire de justifier un des deux profils suivants:

- niveau bac+5 (master, ingénieur ou équivalent) en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’une expérience professionnelle d’au moins 3 ans dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistique ou analyse de données biologiques,
- doctorat en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’au moins 2 années d’expérience professionnelle après la thèse dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistique ou analyse de données biologiques.

Une bonne expérience en enseignement en bioinformatique/biostatistiques sera un plus.

Pour candidater

Les candidatures (motivations, CV détaillé et références) sont à déposer en ligne via l’URL ci-dessous

La date de clôture des candidatures est fixée au 15 février 2015. La présélection des candidat(e)s aura lieu aux alentours du 25 mars. Les candidat(e)s retenu(e)s seront convoqué(e)s pour un entretien entre le 11 et le 15 avril 2016 (dates à réserver impérativement). La prise de poste est prévue pour début septembre 2016.

Référence RH interne : 16005ES