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Project #8528
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#8528 : Comparing V-J gene usage for specific antibody generation
Topics :
Organisms :
Group :
Name of Applicant : Pierre Bruhns
Date of application : 29-06-2017
Unit : Antibodies in Therapy and Pathology
Location : Metchnikoff 4010
Phone : 0145688629
@ Mail : bruhns@pasteur.fr

Project context and summary :

Notre but est de trouver un test statistique capable de dire si deux matrices de nombres sont différents. Ces matrices correspondent à l’utilisation de fragments de gènes (V ou J) pour créer un gène ré-arrangé (V-J) codant pour un anticorps de spécificité particulière. Ici nous avons représenté pour chaque gène V la famille de gène J utilisé (parmi J1, J2, J3, J4). Le nombre correspondant au nombre d’occurrences que nous avons trouvé après séquençage du répertoire d’anticorps spécifiques à partir de souris immunisées contre l’un de ces antigènes. Les matrices ont été réalisées pour les deux chaines codant la spécificité d’un anticorps: la chaine lourde (VH) ou la chaine légère (VL). Le but est de comparer les deux matrices VH l’une avec l’autre, et les deux matrices VL l’une avec l’autre.


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Project Manager : gael.millot@pasteur.fr
Project Type : Short
Status : In Progress


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